Komisija »Iustitia et pax« pri Hrvaški škofovski konferenci je 31. oktobra objavila izjavo, podpisal jo je njen predsednik zagrebški pomožni škof Vlado Košić, v kateri nasprotuje podpisu arbitražnega sporazuma s Slovenijo in hrvaško vlado poziva, naj od njega odstopi tudi za ceno blokade oziroma da Hrvaška ne bi vstopila v EZ. Poudarja, da gre pri zahtevi Slovenije po stiku z mednarodnimi vodami za ozemeljske zahteve, na katere Hrvaška ne sme pristati niti za ceno nečlanstva v EZ. Izrazila je zaskrbljenost za mir in duha dobrih sosedskih odnosov med slovenskim in hrvaškim narodom in zaradi možne kršitve mednarodnega prava, ki bi jo lahko izzval arbitražni sporazum.

Predsednik Komisije Pravičnost in mir pri Slovenski škofovski konferenci nadškof dr. Anton Stres, je, ko je ta izjava prišla v jasnost, še istega dne poslal predsedniku Komisije Iustitia et pax pri Hrvaški škofovski konferenci pismo, v katerem je izrazil obžalovanje, da je bila ta izjava objavljena. Poudaril je veljavo načela pravičnosti, ki je nad »črko zakona« in navedel govor papeža Benedikta XVI. 18. aprila 2008 na sedežu OZN, v katerem je jasno opozoril na spornost »prevlade legalnosti nad pravičnostjo«. Nadškof Stres je predvsem poudaril, da v zvezi z mejnim sporom med Hrvaško in Slovenijo slovenska Komisija Pravičnost in mir »meni, da ni v njeni pristojnosti, da se neposredno vključi v reševanje tega spora in zavzema konkretna stališča do tega, kje in na kakšen način naj bo določena meja med državama. Izrazil je pričakovanje in zahtevo, naj bo meddržavna meja pravična in naj v prihodnosti ne bo več povod za medsebojne spore, temveč osnova za nadaljnjo krepitev prijateljskega sožitja, sodelovanja in sosedstva,« je 2. novembra objavil Tiskovni urad Slovenske škofovske konference.